第三节 R应用于贝叶斯Meta分析软件包

众多研究者为R语言提供了丰富的贝叶斯统计推断的扩展包,用于Meta分析的包主要可以分为以下几大类:一类是调用WinBUGS/OpenBUGS、JAGS、Stan、INLA等贝叶斯分析专用软件,其中R2WinBUGS、R2jags、rjags、runjags等扩展包需要用户编程,如编写Meta分析模型BUGS语言代码等;而bnma、Metastan、gemtc、nmaINLA等直接调用相关软件,无须用户编写BUGS语言代码。一类是无须调用贝叶斯分析软件,如bayesmeta包。

对于WinBUGS/OpenBUGS、JAGS、Stan、INLA等软件包及自带帮助手册等建议到官网去下载,如:

https://www.mrc-bsu.cam.ac.uk/software/bugs/the-bugs-project-winbugs/

http://mcmc-jags.sourceforge.net/

https://mc-stan.org/users/interfaces/rstan

https://www.r-inla.org/home

读者可以从R网站Task Views的Topics中寻找更多的扩展包,寻找的主题是Bayesian和Meta-Analysis。常见的、无须用户编写BUGS语言代码的贝叶斯Meta分析包见表2-2。

表2-2 R软件常用Meta分析扩展包