细胞里的结构功能观

细胞是一个复杂的生命系统。如草履虫、变形虫之类的单细胞生物,拥有口、肛、伸缩泡、纤毛、鞭毛等结构,负责取食、排出废物、运动等功能,所以单细胞生物依靠单个细胞就可以完成一系列的生命活动。多细胞生物由多种细胞形成组织、器官、系统,进而形成个体,不同的细胞长的样子不一样,行使的功能也不同,配合在一起完成复杂的生命活动。比如我们之前讲的红细胞,长成了边缘厚、中间薄的样子。一方面,这样的结构增加了表面积,能更好地和血液中的氧气结合,增加氧气运输的效率,另一方面,扁平圆盘的造型增加了红细胞的韧性,在遇到如羊肠小道一样很细的毛细血管时,红细胞可以“收腹、猫腰”侧身通过,保证在我们身体的最末端的细胞也有充足的氧气和养分的供应。同时,红细胞为了跑得更快,选择在发育的过程中把细胞核和细胞器丢掉,这样就可以轻装上阵(所以红细胞的寿命只有120天),能以最快速度为其他细胞提供补给。这些都是红细胞的结构与功能相互适应的表现。当然,除了红细胞,神经细胞所具有的长长的轴突可以用来传递电信号,精子的长尾巴可以帮助精子游动找到卵细胞……这些都是细胞中结构功能观的体现。

细胞中结构功能观的体现(1)

神经细胞长长的轴突用来传递电信号

细胞中结构功能观的体现(2)

精子的长尾巴帮助精子运动,协助受精作用

细胞中结构功能观的体现(3)

细胞中的大部分结构都体现了结构与功能相互适应的观点。细胞从外向内的基本结构是细胞膜、细胞质和细胞核。

细胞膜:细胞膜像细胞的“城墙”一样,把细胞内的物质与外界隔开,为细胞创造了一个独立的环境,使得各种生化反应都能在细胞内进行。这个“城墙”的砖是由磷脂分子组成的,磷脂分子头部亲水、尾部疏水,靠疏水相互作用力形成了磷脂双分子层,这组成了细胞膜的基本骨架。在细胞膜上,有蛋白质以覆盖、镶嵌、贯穿等方式插在磷脂双分子层上。由于磷脂分子可以在细胞膜上发生侧向扩散、旋转运动、摆动运动等,所以磷脂分子是可以流动的,同时,细胞上的蛋白质也是可以流动的。因此,细胞膜作为细胞的边界,其实是一堵可以流动的“墙”。我们可以做一个小实验,用家里的保鲜膜把一个苹果包起来,再试着让苹果用力穿过这层膜,这时保鲜膜会先变形,进而破裂,直到留下一个无法复原的大洞。但是,细胞膜不一样,当某些物质穿过细胞膜的时候,细胞不会破损,细胞膜仍旧是完整的,这是因为细胞膜磷脂分子具有流动性(当然,这与膜上的蛋白质也有密不可分的关系)。对于较大的或不易穿过细胞膜的物质,细胞可以用胞吞和胞吐的方式使其进出细胞,比如,变形虫吃食物(胞吞)、细胞分泌胰岛素(胞吐)等。表1总结了细胞膜的流动镶嵌模型如何体现出结构与功能的关系,并反映出结构的流动性特点和功能的选择透过性特点。

表1 细胞膜的流动镶嵌模型

除了作为细胞“城墙”砖的磷脂分子外,细胞膜上还有发挥重要作用的蛋白质,它们就像是“城墙”上的门和窗。有的膜蛋白是受体,能识别外界来的分子并把信号传递到细胞中去,比如,我们能闻到各种味道,就是因为气味分子可与鼻腔细胞上的气味分子受体结合。有的膜蛋白是通道蛋白和转运蛋白,能够把物质从细胞内运出来,或者从细胞外运到细胞里面去,比如,钾离子通道可以向内或向外运输钾离子,葡萄糖转运蛋白可以将葡萄糖转运到细胞中去让葡萄糖被细胞利用。

下面我们以钠离子通道为例来分析结构与功能的关系。钠离子通道负责动作电位的起始和延伸,它在轴突传导和神经元的兴奋性等生理作用上发挥着重要的作用。我们的心脏能跳动、肌肉能活动、大脑能产生记忆等都与钠离子通道密切相关。在2017年之前,人们对钠离子通道的研究只集中于电生理和生化研究,对真核钠离子通道的结构一无所知。清华大学颜宁教授团队经过10年的努力,终于在 2017 年获得第一个真核钠离子通道的结构,并在随后解析了人源钠离子通道结构。人源钠离子通道由约 2000 个氨基酸组成,包含 4 个结构域,每个结构域都含有 6 次跨膜螺旋(S1~S6)。其中S1~S4 构成电压感受结构域,负责感受跨膜电势的变化;S5~S6 及中间的 P 区域(P-loop)构成中间的孔隙结构域,负责离子的筛选。在孔隙结构域中,自外而内有两个区域,第一个是离子选择器,它让钠离子通道专一性地选择钠离子,把其他离子都排除在外。另一个是胞内的门控区域,钠离子通道的开放和关闭主要取决于这个胞内门控区域的直径。

流动镶嵌模型

钠离子通道工作模型

可见,有什么样的结构就对应着什么样的功能,钠离子通道工作模型从分子水平上体现了结构功能观。

细胞质:细胞质包括细胞质基质、细胞器和细胞骨架。细胞器“浸”在一团黏稠的液体(细胞质基质)中,发挥不同作用。细胞里面有很多的细胞器,包括线粒体、核糖体、内质网、高尔基体、溶酶体、叶绿体等,我们重点讲解其中两个细胞器:线粒体和叶绿体。线粒体有双层膜,内膜向内折叠形成嵴,这样就会增大内膜面积,为酶的附着提供位点。为什么要这么多的酶呢?因为线粒体的内膜是细胞有氧呼吸第3步的主要场所,大量的酶能够让有氧呼吸迅速进行,从而为细胞提供大量能量。叶绿体作为植物细胞的一种细胞器,其内具有类囊体,多个类囊体堆叠成基粒,增大膜面积,为与光合作用有关的酶和色素提供大量附着位点,便于光合作用的顺利进行。

线粒体内膜向内折叠形成嵴(结构)为有氧呼吸酶的附着提供了大量的位点,保证了有氧呼吸能为细胞提供大量的能量(功能)叶绿体内有类囊体(结构),增大了细胞内的膜面积,为与光合作用有关的酶和色素提供大量附着位点,便于光合作用的顺利进行(功能)

线粒体和叶绿体中结构功能观的体现

细胞内的细胞器虽然具有多样性,但细胞不是各种细胞器的简单堆叠,而是各种细胞器密切联系、分工合作形成的统一整体。例如,像胰岛素、抗体之类的蛋白质,是从细胞里分泌出来的。这些分泌蛋白在细胞中需要经历一系列不同细胞器的加工才能形成。先由核糖体合成多肽链,然后再经由内质网、高尔基体等进行加工和运输才能形成成熟的、折叠正确的蛋白质,再由囊泡运输出细胞。这些细胞器配合在一起,共同完成了分泌蛋白形成这一过程。

细胞内各种细胞器密切联系、分工合作

细胞核:细胞核是细胞的控制中心,控制细胞的代谢与遗传。细胞核能行使这样的功能与其结构密切相关,核膜将核内物质与细胞质分开,保证了核内代谢反应不受干扰;核膜上的核孔实现了细胞核和细胞质之间的物质交换和信息交流,像mRNA(信使核糖核酸)之类的物质就可以通过核孔到达细胞质中。核仁与rRNA(核糖体核糖核酸)、核糖体形成有关,这样会进一步影响到遗传信息传递的翻译过程。细胞核里还有染色体,是由DNA和蛋白质组成的,其中,DNA是遗传物质。DNA作为遗传物质,一方面要求稳定,不能随意被破坏;另一方面,又要求能复制自身,所以又需要不是那么稳定。这两者看起来是相互矛盾的。那DNA到底长什么样子才能够既稳定又不稳定呢?

DNA结构的发现是生物学发展中最重要的历史节点之一,它标志着分子生物学的开端。20世纪四五十年代,人们对遗传物质到底是DNA还是蛋白质争论不休。人们不相信由4个碱基组成的DNA能够充当遗传物质。1953年,两个名不见经传的小人物给出了最终答案,一个是本来进行噬菌体遗传研究的沃森,另一个是37岁还未拿到博士学位的克里克,他们看到了富兰克林在1951年11月拍摄的一张十分漂亮的DNA晶体X射线衍射照片,于是他们结合前人的实验,将DNA是遗传物质这一事实一锤定音。他们通过观察照片,领悟到DNA是两条链,而且以磷酸为骨架相互缠绕形成了双螺旋结构,氢键把双螺旋结构连接在一起。他们把自己的猜想发表在1953年4月25日出版的《自然》杂志上。就这短短的一页半纸,构筑了生物学历史上最重要的发现之一。为什么DNA结构如此重要呢?因为它从根本上解释了DNA能充当遗传物质的原因。DNA作为遗传物质,既需要稳定地存在、不能随意被分解,又需要不稳定,例如能在解旋后精确地进行自我复制并且能产生变异—这些看似矛盾的功能都能在DNA的双螺旋结构上得到完美统一的解释。

DNA 分子是由两条链相互缠绕组成的,脱氧核糖和磷酸交替连接,排列在外侧,构成基本骨架;碱基排列在内侧,通过碱基互补配对原则,碱基之间就像钥匙和锁孔一样通过氢键连接在一起。我们可以把DNA的结构想象成衣服上的一条拉锁,外侧由磷酸和脱氧核糖交替排列在一起,就像是拉锁上的布带,使DNA保持稳定,保证了DNA作为遗传物质不容易被降解或随意丢失。里面的碱基就像是拉锁凸出来的“齿”一样,A和T配对,G和C配对,保证了不同物种的遗传物质不尽相同。而且,由于内侧碱基之间是由氢键相连的,在解旋酶的作用下能够发生解旋,实现精确的自我复制和遗传信息的传递;同时,由于两条链发生了解旋,DNA形成了不稳定的状态,增加了突变的概率,于是产生了变异。而这一点对于生物进化来说非常重要,因为突变为进化提供了原材料,有了突变才有可能产生自然选择。可见, DNA结构完美解释了其作为遗传物质的功能,结构对于解释功能发挥的机制具有至关重要的作用。

DNA分子的结构